土木工程专业源自1980年开设的工民建专科专业，其中1982年招收一届本科生，之后为专科层次办学。随着2002年学校筹办本科院校之后，于2005年招收全日制本科生，2009年以优秀成绩通过学士学位授予权评审，2009年有第一届本科毕业生。
本专业于2008年获批校级品牌专业，2012年通过验收；2013年获批江苏省土木类重点专业，2017年通过江苏省教育厅组织的验收；2019年获批江苏高校一流本科专业。
土木工程专业现有教师35人，其中教授8名、副教授16名；具有博士学位教师19名；江苏省“333工程”培养对象2名、江苏省“青蓝工程”优秀青年骨干教师培养对象3名、江苏省“六大人才高峰”培养对象2名；南京市科技创新团队1个。此外，聘请8名具有高级职称的企业专家作为兼职教师参与专业建设和教学。
土木工程专业近3年累计毕业336人，目前在校生327人。据麦可思连续3年调查显示，本专业在就业竞争力指数、毕业时掌握的基本工作能力等方面在全校专业中均居于前列。学生获江苏省大学生创新创业训练计划项目16项；土木工程结构创新竞赛、力学竞赛等国家级与省级奖项73项；发表论文18篇；授权专利97项，其中发明专利8项。毕业设计（论文）获省级本科优秀毕业设计（论文）三等奖3项。
在中央财政支持地方高校发展专项等经费支持下，土木工程实验中心已建设成为江苏省实验教学示范中心，包括结构工程等13个专业实验室，总面积5000m2；拥有仪器设备总值2600万元，包括美国MTS疲劳试验机，全尺寸大吨位多通道伺服实验机系统等；配有大型商业版有限元分析软件ANSYS，以及PKPM等4个正版专业设计软件。获批1个江苏省工程技术研究中心、2个南京市工程技术研究中心、1个省级重点实验室、1个市级重点实验室（培育）。建有南京大地建设集团有限公司等10个稳定的校外实践教学基地。
近年来，土木工程专业教师主持教育部产学合作项目1项、省市级课题2项。获得国家级教学成果二等奖1项（参与）、省级教学成果二等奖1项。开发1门慕课在教育部爱课程网上开课、2门微课获江苏省微课高校竞赛二、三等奖。完成江苏省高校重点立项建设教材1部，出版教材10余部。
承担国家自然科学基金4项、江苏省自然科学基金4项和省厅级项目20余项。另外还承担南京禄口机场二期工程飞行区地基监测项目、苏南运河锚地挡墙加固工程等科技服务项目。获得国家发明专利30余项，发表SCI、EI和ISTP检索论文及核心期刊论文150余篇。获得江苏省科技进步三等奖2项；中国公路学会科技进步二等奖1项、南京市科技进步一等奖2项、三等奖1项、江苏省教育厅技术发明三等奖1项。
